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小队列大发现!质谱与Olink、SomaScan跨平台揭示AD稳态蛋白标志物,ag尊龙凯时助力生物医疗新进展

来源:溥子芸 日期:2025-03-12

阿尔茨海默氏病(AD)正成为日益严重的公共卫生挑战,当前尚无有效的针对性治疗手段。多组学分析已揭示了AD脑内除了β-淀粉样蛋白斑块和神经元tau蛋白缠结之外的一系列复杂病理生理过程,但这些过程在疾病进程中的演变仍有待深入研究。因此,亟需多种生物标志物以提升我们对AD潜在复杂病理过程的理解。

小队列大发现!质谱与Olink、SomaScan跨平台揭示AD稳态蛋白标志物,ag尊龙凯时助力生物医疗新进展

最近,来自ag尊龙凯时支持的美国埃默里大学医学院阿尔茨海默病研究中心的团队在《Alzheimer’s Research & Therapy》期刊上发表了题为“Multi-platform proteomic analysis of Alzheimer’s disease cerebrospinal fluid and plasma reveals network biomarkers associated with proteostasis and the matrisome”的研究。该研究运用了三种不同的蛋白质组学平台(SomaLogic SomaScan、Olink、TMT质谱法),对来自相同受试者的阿尔茨海默病脑脊液(CSF)和血浆样本进行了分析(n=18对照,n=18AD)。

研究通过对跨平台数据的相关及表达分析,发现脑模块枢纽蛋白(如SMOC1)可能成为有前景的AD生物标志物。

研究材料与步骤

研究材料包括18例AD患者与18例健康人群的血浆及脑脊液样本。研究步骤如下:

  1. 进行血浆与脑脊液中的蛋白质检测。
  2. 进行跨平台蛋白比较。
  3. 血浆与脑脊液蛋白含量进行比对。
  4. 比较脑蛋白模块在两种体液中的表现。
  5. 描述共表达网络与相关通路。

研究结果

研究结果表明,在脑脊液和血浆中的蛋白质组学测量经过预处理和技术分析。研究者利用来自埃默里大学的对照组(n=18)和AD患者(n=18)的脑脊液与血浆样本,进行了TMT质谱分析、Olink检测(1196种目标蛋白)、以及SomaScan(v41,靶向6596个特征蛋白)。分析显示CSF的信噪比相较于血浆样本更低、缺失值更高,最终筛选出适合后续分析的数据。

此外,跨平台比较显示,在三个蛋白质平台上,总共检测到CSF中4655种独特蛋白质,血浆中则为6794种。不同平台间的相关性分析表明,数据之间的相关性维持在0.6至0.8之间,结果表现良好。

在AD组中,CSF和血浆的蛋白质数量均有所减少,而血浆的减少程度更为显著。进一步分析显示,SMOC1在AD组的水平普遍升高,并与CSF中的Aβ/Tau水平呈现相关性。

作者利用AMP-PD联盟中的对照组数据,考察了SMOC1在AD的特异性表现,发现其在CSF和血浆中水平之间存在一定相关性,但对照组则表现不佳。此外,CSF中发现多种与AD相关的共表达网络模块,涉及蛋白质稳态、突触、补体和糖代谢。

总结

本研究利用质谱法、Olink靶向蛋白组和SomaScan高通量靶向蛋白组对AD的脑脊液和血浆样本进行了全面的跨平台检测,结果显示出不同蛋白模块在这两种样本中的不同表达关系。其中,潜在的生物标志物将有助于实现患者的分层、诊断、疾病监测以及后续治疗开发。

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